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Western blot的實驗技巧
Western blot實驗看似簡單,但流程又很繁瑣。很多同學往往做了很長時間的實驗之后,卻得不到理想的實驗結果,甚是苦惱。其實,Western blot實驗是有很多注意點和實驗技巧的,小編今天給大家整理了一些非常關鍵的實驗事項:
蛋白提取
蛋白提取是實驗的第一步,也是最重要的一步,很多實驗結果不好往往是由于蛋白提取出現了問題(但是很多同學卻忽視了蛋白提取質量對實驗結果的重要性)。以下幾個因素是經常導致WB結果不理想的原因:
★ 蛋白提取的裂解液中,目的蛋白含量太低
一些蛋白在組織中的蛋白含量很低(例如轉錄因子等核蛋白,GPCR、CD分子等膜蛋白),如果提取蛋白的時候沒有做到富集,往往后續WB顯色的時候會導致背景很臟,甚至導致白板的出現。這時候需要專門的蛋白富集提取方法來提取蛋白,例如相對于全細胞或全組織裂解物來說,核表達蛋白在細胞核裂解物總蛋白中占有相當大的比例,這樣凝膠條帶中可以載入更多的目的蛋白。另一個優點是排除了雜質成分潛在的交叉反應。濃縮使信號大化(例如檢測核蛋白要用核裂解物)。
如上圖結果所示,使用特定的蛋白提取試劑盒提取蛋白,可以有效的富集特定細胞組分,保證目的蛋白的上樣量。
注:實驗中使用GAPDH(M20006)分析細胞漿蛋白提取物,使用ATPase(T40109)分析細胞膜蛋白提取物,使用Histone(P30266)分析細胞核蛋白提取物。
膜蛋白產品提取試劑盒貨號:A10008,核蛋白產品提取試劑盒貨號:A10009
★ 蛋白提取后出現降解
在蛋白質的提取過程中,蛋白酶在細胞或組織裂解后釋放,降解蛋白質樣品,從而降低蛋白質樣品的量。這樣往往導致后續實驗中檢測不到目的蛋白或蛋白降解帶明顯出現。為防止蛋白質被蛋白酶所降解,要加入特異性的蛋白酶抑制劑來抑制蛋白酶活性。很多同學在實驗過程中也加入了蛋白酶抑制劑,但是為什么還會出現蛋白降解呢?主要原因是很多同學往往只加入了一種蛋白酶的抑制劑,但是蛋白酶是有非常多種類的,每一種蛋白酶均需要一種特定的蛋白酶抑制劑來抑制其蛋白酶活性。所以為了防止蛋白降解,需要加入各種蛋白酶抑制劑。
方便的做法是購買現成的Cocktail形式的蛋白酶抑制劑,這種蛋白酶抑制劑是將常用的數種蛋白酶抑制劑混合到一起,制備成了即用型的試劑產品,用起來很是方便。
Abmart提供了一款Cocktail形式的蛋白酶抑制劑,可以有效地防止蛋白提取過程中的蛋白降解問題。A10004,200X 蛋白酶抑制劑復合物(200X Protease InhibitorCocktail)【同Sigma P1860】。
電泳轉膜
對于較大分子量的蛋白(大于100 kDa),電泳轉膜這個步驟是很容易出現問題的,主要是包括以下幾個方面:
1. 對于大蛋白而言,其在凝膠電泳分離遷移較慢,而從凝膠轉出也非常慢,因此對于這種大分子量蛋白應該用低濃度的凝膠,8% 或更低,但因低濃度的膠非常易碎,所以操作時需十分小心。
2. 大蛋白易在凝膠里形成沉淀,從而影響轉膜。轉膜時在電轉移緩沖液加入SDS 至終濃度0.1%,避免出現這種情況。甲醇易使SDS 從蛋白上脫失,因此相應降低甲醇的濃度至10% 或更低,以防止蛋白沉淀。
3. 降低電轉移緩沖液中甲醇的比例,這樣可以促進凝膠的膨脹,更易于大蛋白的轉出。
4. 只有使用硝酸纖維素膜時,甲醇才是必需的。如果是PVDF膜,甲醇可以不必加入電轉移緩沖液中,但轉膜前PVDF 需用甲醇活化。
5. 選擇濕式,4℃ 轉膜過夜,以取代半干式轉膜。
這里,同學們需要注意:很多同學習慣使用預染marker判斷轉膜是否成功。該方法很是便捷,但是卻無法判斷每個泳道的轉膜情況和是否有氣泡污染。所以最好方法是使用“麗春紅染色QC轉膜質量"。
為檢測轉膜是否成功,用TBST 洗膜,然后用麗春紅染色,室溫下震蕩5分鐘。然后將膜浸泡在水中直至水變清且出現蛋白條帶。觀察膜上的條帶是否清晰,各分子量條帶均可見,無明顯白色空斑(氣泡導致)。
用TBST 或水重復洗膜直至膜*脫色,PVDF 膜需用甲醇活化后再用TBST 洗,然后進行后續實驗操作。
10*麗春紅貯備液:2% 麗春紅S 溶于30% 三氯和30% 磺基水楊酸,震搖混勻。(或者購買現成的10*麗春紅貯備液,貨號: A10010)
一抗孵育/二抗孵育
★ 一抗稀釋液
為防止實驗結果的背景比較臟,最好使用封閉液來稀釋一抗,這樣可以避免一抗可能與封閉液有交叉反應。
★ 使用錯二抗
有些抗體是小鼠抗體,有些抗體是兔子抗體,均需要使用對應的二抗來顯色,用錯了就會導致白板。特別是很多時候希望一抗和內參抗體同時孵育,使得目的蛋白檢測和內參調平一步到位。但是很多時候是一抗是兔多抗,內參是小鼠單抗,一旦大意疏忽,就會導致實驗出錯。
Abmart推出了一款“防錯二抗"(鼠兔通用二抗),一管抗體解決所有問題,讓實驗變得很輕松。
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