蛋白建模研究有助增強抗體藥物效力

【資料簡介】

蛋白建模研究有助增強抗體藥物效力
美國科學家zui近開發出一種計算機建模方法，它能夠通過預測抗體的結構變化來提升藥物的效力。相關研究論文9月23日在線發表于《自然—生物技術》上。

該研究成果源自美國麻省理工學院（MIT）Dane Wittrup和Bruce Tidor教授在實驗和計算機模擬上的傾力合作。研究人員分析了一種特殊抗體的氨基酸取代的多種可能性，并計算出哪種取代方式所產生的結構變化能夠導致抗體與標靶發生zui緊密的作用。

利用該模型，研究人員已經對抗結腸癌藥物愛必妥（Erbitux）進行了改造，并使抗體與標靶的親和力增加到原始蛋白分子的10倍。此外，他們將該方法應用于一種抗溶解酵素抗體D44.1，提升了它的效力。論文*作者Shaun Lippow表示，“將抗體蛋白結構和預測信息結合起來，我們就能做出zui合理的選擇，從而提升蛋白的功能。”

美國國立常規醫學研究所（NIGMS）負責計算生物學項目的Janna Wehrle表示，“該項研究是現代計算技術用于加速藥物開發的范例。”

傳統的抗體藥物開發方法主要通過自然選擇，即先從小鼠體內提取出抗體，然后在實驗室中進行培養，使其進化，并檢測其功效。該方法從時間上和研究人員可操控的層面上都不理想。相比之下，MIT科學家的新方法能夠快速分析抗體大量的可能變異和構造變化，并預測出該蛋白分子和標靶的親和力。

研究人員表示，蛋白建模方法能夠減少抗體藥物開發的時間和成本，并有助于科學家設計改造其他用途的蛋白，比如將生物質轉化為能源的酶。