準備工作:
細菌培養:小量提取質粒dna鑒定正確后,將菌液以1/50~1/20體積的比例接種到250ml液體培養基中,37℃振蕩培養過夜至對數生長晚期。
注:培養體積與zui終質粒DNA的收獲量并無線性關系。只要培養條件適宜,50ml的培養液有時也可得到總量高達1mg以上的質粒。
操作步驟:
1、細菌的收獲:將菌液倒入合適的離心管中,8000g離心5分鐘,棄上清,并在吸水紙上倒置離心管使上清全部流盡。
2、將細菌沉淀重懸于10ml溶液I中。
溶液I:50mmol/L葡萄糖,25mmol/LTris•Cl(pH8.0),10mmol/LEDTA(pH8.0)
注:(1)若溶液Ⅰ/Ⅱ/Ⅲ配制時間過久,可加入少量;(2)由于沉淀的影響,懸液的體積會達到11~13ml。
3、加15ml溶液Ⅱ,顛倒混勻。
溶液Ⅱ:0.2mol/LNaOH,1%SDS
4、加12ml溶液Ⅲ,輕微振蕩混勻。
溶液Ⅲ:5mol/L乙酸鉀60ml,冰乙酸11.5ml,水28.5ml
5、12000g離心5分種,棄沉淀。將上清轉移到另一離心管中。
6、加入60%體積的異丙醇,顛倒混勻后,室溫靜置5分鐘。12000g離心5分鐘,棄上清。
7、沉淀溶解于4~6mlTE中,加入1/50體積RNaseA貯存液,顛倒混勻,37℃靜置10分鐘。
8、加入1/2體積的Tris飽和酚、1/2體積的氯仿-異戊醇(24:1)混合液,劇烈振蕩混勻。
9、4℃12000g離心30秒,將上層液體與少量下層液體轉移到另一離心管后,再12000g離心5分種,小心吸取上層液體。
10、加入等體積13%聚乙二醇(PEG8000)-1.6mol/LNaCl混合液,顛倒混勻,冰上靜置0.5~2小時。
11、4℃12000g離心10分種,棄上清,DNA沉淀用70%乙醇洗滌。
12、沉淀干燥后,溶解于適量高壓滅菌的水中。
注:(1)溶解體積一般為0.2~1ml;(2)此時得到的是已經純化的質粒DNA,可直接進行各種酶學操作。
13、取樣品進行電泳或紫外定量。