1、根據(jù)個體發(fā)育過程中出現(xiàn)的先后次序不同，干細(xì)胞又可分為胚胎干細(xì)胞和成體干細(xì)胞。

干細(xì)胞是一類具有自我更新和分化潛能的細(xì)胞。根據(jù)其發(fā)育階段，它包括胚胎干細(xì)胞和成體干細(xì)胞。胚胎干細(xì)胞是一種高度未分化細(xì)胞。它具有發(fā)育的性，能分化出成體動物的所有組織和器官，包括生殖細(xì)胞。成體干細(xì)胞是存在于成年動物的許多組織和器官，比如表皮和造血系統(tǒng)，具有修復(fù)和再生的能力的細(xì)胞。在特定條件下，成體干細(xì)胞或者產(chǎn)生新的干細(xì)胞，或者按一定的程序分化，形成新的功能細(xì)胞，從而使組織和器官保持生長和衰退的動態(tài)平衡。過去認(rèn)為成體干細(xì)胞主要包括上皮干細(xì)胞和造血干細(xì)胞。zui近研究表明，成體干細(xì)胞普遍存在于機(jī)體的大多數(shù)組織器官中。

在胚胎的發(fā)生發(fā)育中，單個受精卵可以分裂發(fā)育為多細(xì)胞的組織或器官。在成年動物中，正常的生理代謝或病理損傷也會引起組織或器官的修復(fù)再生。胚胎的分化形成和成年組織的再生是干細(xì)胞進(jìn)一步分化的結(jié)果。傳統(tǒng)觀點認(rèn)為：胚胎干細(xì)胞是的，具有分化為幾乎全部組織和器官的能力。而成年組織或器官內(nèi)的干細(xì)胞一般認(rèn)為具有組織特異性，只能分化成特定的細(xì)胞或組織。這個觀點目前受到了挑戰(zhàn)。的研究表明，組織特異性干細(xì)胞同樣具有分化成其他細(xì)胞或組織的潛能，也就是說干細(xì)胞具有橫向分化的能力。這為干細(xì)胞的應(yīng)用開創(chuàng)了更廣泛的空間。

2、按分化潛能的大小 ，干細(xì)胞還可分為三種類型：

（1）性干細(xì)胞，它具有形成完整個體的分化潛能。如胚胎干細(xì)胞（簡稱ES細(xì)胞），具有與早期胚胎細(xì)胞相似的形態(tài)特征和很強(qiáng)的分化能力，可以無限增殖并分化成為全身200多種細(xì)胞類型，進(jìn)一步形成機(jī)體的所有組織、器官。人類的干細(xì)胞可以分化成人體的各種細(xì)胞，這些分化出的細(xì)胞構(gòu)成人體的各種組織和器官，zui終發(fā)育成一個完整的人。人類的精子和卵子結(jié)合后形成受精卵，這個受精卵就是一個zui初始的干細(xì)胞，受精卵繼續(xù)分化，在前幾個分化過程中，可以分化出許多干細(xì)胞，提取出這些細(xì)胞中的任意一個放置到婦女子宮中，就可以發(fā)育出一個完整的人體。

（2）多能性干細(xì)胞，這種干細(xì)胞具有分化出多種細(xì)胞組織的潛能，但卻失去了發(fā)育成完整個體的能力，發(fā)育潛能受到一定的限制，骨髓多能造血干細(xì)胞是典型的例子，它可分化出至少十二種血細(xì)胞，但不能分化出造血系統(tǒng)以外的其它細(xì)胞。

（3）單能干細(xì)胞（也稱專能、偏能干細(xì)胞），這類干細(xì)胞只能向一種類型或密切相關(guān)的兩種類型的細(xì)胞分化，如上皮組織基底層的干細(xì)胞、肌肉中的成肌細(xì)胞或叫衛(wèi)星細(xì)胞。