冷凍離心機主要是從液體混合物中提煉出需要的成分，根據每種物質的密度不同，經過高速旋轉，密度大的液體沉在底層，密度小的液體浮在上面，這樣就將液體分層，提煉出我所需要的純凈物。它應用于醫藥、化工等許多領域。冷凍離心機除具有低速冷凍離心機的性能和結構外，離心機所用角式轉頭均用鈦合金和鋁合金制成。離心管為具蓋聚乙烯硬塑料制品。這類離心機多用于收集微生物、細胞碎片、細胞、大的細胞器、硫酸沉淀物以及免疫沉淀物等。
冷凍離心機垂直轉子的特點：
1、分離時間短。這是由于垂直轉子樣品區帶移動的徑向距離短，可以獲得較為小的K值。
2、受管壁效應的影響較為小。
3、能夠離心較大體積的樣品。
4、分辨率高。由于離心過程中樣品區帶是沿離心管的長度鋪開，轉子降速過程中梯度重新定向，使區帶間距增大。
5、提供較為大的離心力。離心管所插的位置靠近轉子的外邊緣，其較為小相對離心力比相同直徑的水平轉子和角轉子都大。
6、梯度容量大。垂直轉子梯度的橫截面積大，在梯度上鋪放大量樣品是可行的。
 
作為一種精密的設備，冷凍離心機在使用的時候需要注意以下事項：
1、儀器使用時須放置在堅固、防震、水平的臺面上，并確保機腳均衡受力
2、嚴禁超過轉子設計規定的高轉速運行。
3、離心管必須對稱放置，不可單數管運行,管內溶液必須均勻一致以確保平衡運行。
4、運轉過程中不得移動離心機，嚴禁打開門蓋。
5、分離結束后，應及時將儀器擦拭干凈，同時關閉儀器的電源開關并拔掉電源插頭。