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在污水處理廠中所使用的機械格柵對細菌的處理有很強的能力，先是將污染較嚴重的垃圾進行過濾后進行污水再處理的過程，其中細菌的長度為0.2-10um，廣泛分布于自然界中，對營養的需求也多種多樣。多種無害或是有益的細菌生長在人類的腸道里，并隨糞便排出。患病人群的糞便里還含病原細菌。因此，城市污水機械格柵中可能含有種類各異、農度范圍極廣的細菌要處理，其中包括病原菌。

人和動物的糞便中的腸道細菌通過糞-口途徑進行傳播，通常會導致急性腹瀉，某些細菌還會導致更為嚴重的特殊癥狀。在發展中國家，傳統的水媒疾病仍大量存在，如痢疾、傷寒和霍亂等。
而美國從20世紀20年代開始就已經很好地控制了這些疾病。然而彎曲桿和、非傷寒沙門氏菌和致病性大腸桿菌在美國每年仍能導致300萬起癥狀。根據患病者的住院比例調查，嚴重的是致病性大腸桿菌、志賀氏菌和沙門氏菌。

從1970年到1990年，在美國暴發的水媒疾病中，有14%是由腸道細菌引起的。可見，腸道病原菌在美國仍是水媒疾病的重要病原，污水處理廠里也必須要有機械格柵設備幫助處理污水及分解清除細菌才行。