目前，國內外印染廢水處理仍以生化法為主，相關的研究主要集中在生物強化、菌種篩選、微生物固定化、膜生物反應器以及生化技術組合方面。
生物強化是指在傳統生物處理單元中投加特定功能的微生物或與微生物系統具有協同作用的藥劑，從而增加對特定污染的降解能力。在生物系統中投加適量的粉末活性炭（PACT法）或鐵鹽（生物鐵法）能明顯強化生物處理效果。
生物篩選是利用誘變育種、原生質融合、基因工程等生物技術，分離、選擇和組建新型的高效微生物菌種菌群。中國科學院微生物所從污泥和生物膜中了分離出對多種染料能快速脫色的優良菌株，其中以產堿桿菌和轉化單胞菌脫色作用較優。
膜生物反應器是膜分離技術與生物反應器相結合的新型水處理技術。由于膜組件對于活性污泥的截留作用，實現了污泥停留時間和水力停留時間的有效分離；同時，MBR中能保持較高的活性污泥濃度，在較高容積負荷情況下實現了較低的污泥負荷。膜生物反應器在國外已有印染廢水處理的成功案例，國內也有少量應用。
厭氧與好氧組合是印染廢水生化處理的主流工藝，其中厭氧一般用于水解酸化段。厭氧生物處理對直接染料、活性染料、酸性染料、陽離子染料等可溶性染料大多數在不同程度上是可降解的。有研究認為，厭氧試驗水力停留時間3d和8h結果差別不大，印染廢水的厭氧過程實質處于水解酸化段。HRT為16h時COD和BOD去除率達到高峰，分別為31.2%和16.3%。
色度去除率與HRT的變化相關性不明顯；當HRT超過8h時，色度去除率不再隨HRT的增加而增加。其研究認為，水解酸化后廢水的可生化性得到明顯提高；印染廢水的水解酸化應著重于發揮其對廢水可生化性提高的效能上，HRT宜控制在10h以上。即使進水COD波動較大，ABR也能運行良好。進水COD平均755.4mg/L，平均去除率為43.9％；進水色度平均342倍，平均去除率為76.6％。
印染廢水B/C值由0.29提高到0.43，廢水可生化性明顯改善。HRT為24h、18h、14h時的COD去除率分別為43.1%、32.6%和20.5%。研究還通過離子流譜圖證明，難生物降解的復雜有機物經厭氧水解后存在開環、斷鍵、裂解、取代、還原等結構變化，進而轉化成較易生物降解的有機物。
一般情況下，規模較小的印染廢水好氧生化段較多采用接觸氧化法；規模較大時采用活性污泥法。這主要是因為，規模較小的廢水負荷變化較劇烈，而接觸氧化法由于微生物固定生長于填料載體而具有更好的穩定性。山東聚福源環保設備有限公司生產 MBR一體化設備利用膜生物反應器(MBR)進行污水處理及回用的一體化設備，其具有膜生物反應器的所有優點：出水水質好，運行成本低、系統抗沖擊性強、污泥量少，自動化程度高等，另外，作為一體化設備，其具有占地面積小，便于集成。它既可以作為小型的污水回用設備，又可以作為較大型污水處理廠(站)的核心處理單元，是目前污水處理領域研究的熱點之一，具有廣闊的應用前景。
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