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PCR反應(yīng)假陰性及假陽性問題可能原因及解決方法

時間:2023/10/23閱讀:2831
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一、假陰性(無擴增產(chǎn)物)

現(xiàn)象:正對照有條帶,樣品無條帶

可能原因:

· 模板:含有 Taq 酶抑制劑、雜蛋白,模板上樣量低或模板降解

· 引物:引物降解,引物設(shè)計不合理

· 試劑:酶失活,buffer 不合適

· 反應(yīng)條件:退火溫度高,延伸時間短

解決方法:

· 純化模板并重新提取,并檢測模板是否含有抑制劑

· 重新設(shè)計引物并低溫保存

· 優(yōu)化 buffer,摸索鎂離子濃度或適當(dāng)加入 DMSO(小于 0.3%)

· 提高退火溫度,增加延伸時間(反應(yīng)條件參照試劑盒說明書)

二、假陽性

現(xiàn)象:空白對照出現(xiàn)條帶

可能原因:

· 引物設(shè)計不適,與目的序列具有同源性

· 試劑污染:水、移液槍等被核酸污染

· 樣品間出現(xiàn)交叉污染

解決方法:

· 實驗儀器高壓滅菌

· 實驗試劑(酶除外)高壓滅菌,離心管槍頭一次性使用

· 規(guī)范實驗操作

· 假陽性可通過巢式 PCR 解決,或者使用特異性較高的試劑盒擴增


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