液相色譜柱是色譜分析過程中重要的部分，相當于人體的“心臟”。根據自己要分析的樣品去選擇合適的液相色譜柱，需要考慮不同參數將會造成什么影響，比如粒徑、酸堿性、極性和分子量大小等。
液相色譜柱在使用前，要進行柱的性能測試，并將結果保存起來，作為今后評價柱性能變化的參考。在做柱性能測試時要按照色譜柱出廠報告中的條件進行，只有這樣，測得的結果才有可比性。
即使是液相色譜柱也分很多類型，比如正相、反相、C18柱、親水性色譜柱等等。只有了解影響分析柱性能的因素，才能結合目標分析物的性質、需要達到的分析效果及實驗室條件來選擇適合的色譜柱。
在很多色譜分析中涉及的化合物樣品絕大部分都可以使用反相分離模式，恒譜生有許多可用于反相分離的液相分析柱，比如USHAC18、USHAC8、USHAC4、USHA苯基柱、USHA氰基柱等。
硅膠純度對峰形有很大液相，硅膠雜質和殘留的金屬離子會影響樣品的峰形，如果硅膠表面的金屬含量高會影響堿性化合物的峰形，易發生拖尾。球形顆粒柱效高、重現性好、柱床結構均勻。
不規則的顆粒柱床結構不均勻、流動相線速度不均勻，容易形成譜帶展寬；平均顆粒直徑，粒徑越小，柱效越高，柱壓也越高。粒徑分布越廣則柱效越低，壓力越大。
