凝膠成像系統是一個集觀察、拍攝和分析凝膠于一體的凝膠分析系統。使用該系統可以對凝膠進行定量和定性分析。
凝膠成像系統采用數碼相機或高分辨率CCD攝影將攝取的圖像直接輸入計算機系統。在暗箱中的光源燈照射下，通過調節變焦光圈、變焦倍數及焦距使藥品清晰及大小合適。圖像社區獲得后，通過軟件中圖像處理菜單進行調整和圖像優化。以降低圖像本底噪聲。一般經過這樣處理后能得到清晰的凝膠圖片。
凝膠成像系統可以對樣品進行定量和定性分析。
凝膠成像分析系統進行定量和定性分析的原理是：光源發出的光照射樣品，不同的樣品對光源吸收的量有差異。光密度與樣品濃度或者質量成線性關系，將未知樣品的光密度與已知濃度的樣品皮帶的光密度進行比較，可以得到未知樣品的濃度或者質量，做定量分析。
凝膠成像分析系統定性分析的原理是：由于樣品在電泳凝膠或者其他載體上的遷移率不一樣，將未知樣品在圖譜中的位置與標準品在圖譜中的位置相比較，可以確定未知樣品的成分和性質，做定性分析。