餐廚垃圾、菜場果蔬垃圾和蔬菜基地果蔬垃圾分別經由密閉運輸車輛輸送至處理站，直接卸入卸料/分揀平臺，經人工分選將其中的塑料和紙質包裝類垃圾以及少量玻璃瓶、金屬物料、磚瓦等無機物料分選出來后，進入破碎機破碎至1-3cm一下，然后進入螺旋擠壓脫水機進行脫水處理，脫除下來的滲濾液進入油水分離，經過處理排入污水管道。擠壓產生的含固率在40%以上的干物料經由皮帶輸送機送入高溫好氧發酵倉內進行高溫好氧發酵處理。
物料在高溫好氧發酵倉內，通過強制通風與內部攪拌翻堆相結合的方式，保證氧氣充分供給，以使物料中的揮發性有機質降解效率達到70%以上，確保處理后產物充分腐熟，以使物料中的寄生蟲(卵)、病原菌，病毒等充分滅活，高溫好氧發酵倉出料經由出料口排出。高溫好氧發酵倉內產生的高濕、高溫和高污染惡臭氣體，排入氣體凈化箱進行凈化。
在設備內預先投入的菌種，通過攪拌混合及適當的溫度提供菌種適合繁殖的條件，在細菌繁殖的過程中將餐廚垃圾中的脂肪、蛋白質、淀粉等物質分解成水和二氧化碳，之后只剩下較少數殘渣的這一過程，就是餐廚垃圾的處理過程。
