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PCR 反應體系條件優化

2024-3-29  閱讀(305)

PCR 反應體系由反應緩沖液(10×PCR Buffer)、脫氧核苷三磷酸底物(dNTPmix)、耐熱 DNA 聚合酶(Taq 酶)、寡聚核苷酸引物(Primer1Primer2)、靶序列(DNA 模板)五部分組成。各個組份都能影響 PCR 結果的好壞。PCR反應需要一定的條件才能完成,這些條件主要有以下方面:

一、緩沖液

任何一個生化反應都必須在一定的緩沖體系中進行,緩沖體系除了提供一定的pH緩沖能力外,還有一些有助于反應進行的成分。PCR反應緩沖液通常采用10 mmol/L Tris-HClpH 8.3-9.0,室溫)緩沖液體系,其中含有可激活DNA聚合酶的活性中心的二價陽離子,一般采用Mg2+,以MgCl2的形式提供,Mg2+的濃度高低可顯著影響 PCR擴增產物的特異性,此外,緩沖液中還含有50 mmol/LK+,有利于引物與模板的退火。有些緩沖液中還加入明膠或血清白蛋白(100 μg/mL)及去污劑(如Twcen20 等),對Taq DNA聚合酶起穩定作用。

二、模板

PCR模板是含有待擴增序列的 DNAmRNAcDNA等,模板數量可直接影響擴增的效果。對于一般的 PCR擴增,104107個模板分子可達到滿意的效果,一般宜用納克(ng)級的克隆DNA、微克(μg)水平的染色體DNA102105拷貝待擴增的DNA片段作為起始材料。除了數量外,模板的質量也非常重要,不能有太多的蛋白質和其他污染,特別是其他DNA的污染,即使是痕量的DNA,也會導致非特異性產物。

三、dNTP

dNTPdATPdTTPdGTPdCTP的總稱。貯備液為pH 7.0 左右,其濃度一般為20 mmol-20℃保存。體系中為20~200 μmol即可,過低則反應速度下降,濃度過高則特異性下降,因為dNTP能絡合溶液中的Mg2+,產生錯配或抑制Taq DNA聚合酶活性。

四、耐熱的DNA聚合酶

PCR反應中使用的 DNA聚合酶必須耐高溫,在90℃以上的高溫下仍能有活性,正是由于耐熱DNA聚合酶的應用才使 PCR技術得以實現,目前使用的耐高溫DNA聚合酶主要有Taq DNA聚合酶、Tth DNA聚合酶、Vent DNA聚合酶、Pfu DNA聚合酶和Pwo DNA聚合酶等。

五、引物

PCR反應的最佳條件

根據大量的研究報道,PCR反應的最佳條件為:①Taq DNA聚合酶的濃度為1.0-2.5 U/100μL反應液;②dNTP的濃度為20200 μmol/L;③Mg2+濃度為0.52.5 mmol/L;④引物的濃度為0.21.0 μmol/L。在準備具體的PCR反應時,還要針對模板特性、PCR儀等進行上述反應體系的優化,并設置試驗確定連退火溫度、延伸時間,建立其相應的PCR反應優程序。




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