氨基酸分析儀，一種采用陽離子交換色譜分離、茚三酮柱后衍生法，對蛋白質水解液及各種游離氨基酸的組分含量進行分析，但針對氨基酸分析進行了細節優化的儀器。采用經典的陽離子交換色譜分離、茚三酮柱后衍生法，對蛋白質水解液及各種游離氨基酸的組分含量進行分析。儀器基本結構同普通HPLC相似，但針對氨基酸分析進行了細節優化（例如氮氣保護、惰性管路、在線脫氣、洗脫梯度及柱溫梯度控制等等）。

1、原理。基于陽離子交換柱分離、柱后茚三酮衍生、光度法測定的離子交換色譜法（IEC）。2、重要指標。滿足分析需要的技術指標如分離度、重復性等要求，而其中的分離度又是更為重要的指標，因為，色譜理論一般以分離度達到1.2作為兩峰基本分離的判定前提，只有峰分開了，才有意義去討論定性和定量的重復性。
3、指標的真實性。有些廠家只標出個別氨基酸的指標如Asp或Arg，或只用平均數據替代全部數據等等，而儀器性能好，經營信譽較高的廠家就會標出全部氨基酸的指標供用戶參考。
4、儀器的可靠性。如果儀器今天堵了、明天漏了，用戶不僅要付出大量人力財力，分析結果的可信度也將大打折扣。
5、儀器的運行成本。例如是否可以使用國產試劑、柱子壽命（以多少次進樣計算、而不以多少年計算）等。
6、儀器設計是否有利于氨基酸分析。例如是否有惰性氣體保護（茚三酮極易被氧化）、是否提供在線脫氣、是否提供溶液和樣品的制冷控制等。
7、售后服務。分析過程中遇到困難是在所難免，廠家必須能夠快速響應、盡快解決問題。另外，常用備件的價格也是一個重要因素，因為用戶在購買前一般難以注意到售后的問題，而很多廠家也沒有公示自己的常用備件價格，這就為將來的使用埋下了隱患，事實上，也的確有很多儀器在出現一些看似微小的故障之后，就因為維修費用太高而被“束之高閣”。

    只要是按照以上的標準去選擇氨基酸分析儀的話，一定能夠選到滿意的儀器，成為您工作中得力的助手。