細(xì)胞培養(yǎng)中的污染分為兩類，化學(xué)污染和生物污染。

化學(xué)污染

　　化學(xué)污染是一些對細(xì)胞有毒性的或?qū)?xì)胞產(chǎn)生刺激的化學(xué)物質(zhì)。這些污染一般來自于沒有洗凈的器皿、不純的化學(xué)試劑和質(zhì)量較差的蒸餾水等。

　　化學(xué)污染中比較引人注意的是細(xì)菌內(nèi)毒素。它是革蘭氏陰性細(xì)菌細(xì)胞死亡后解體釋放出的疏水性的細(xì)胞壁組成物質(zhì)，對塑料等疏水性強的物質(zhì)有很強的吸附能力。細(xì)菌內(nèi)毒素可刺激部分細(xì)胞產(chǎn)生一些激素或細(xì)胞因子，對細(xì)胞生長和實驗結(jié)果產(chǎn)生影響。細(xì)菌內(nèi)毒素是臨床上的zui主要的熱原（即注射到動物體內(nèi)會導(dǎo)致動物發(fā)熱），所以通過細(xì)胞培養(yǎng)生產(chǎn)的疫苗、細(xì)胞因子等用在臨床上的藥品的生產(chǎn)過程中更是要避免細(xì)菌內(nèi)毒素的污染。

生物污染

　　生物污染包括比較容易發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌、霉菌和酵母的污染，和較難發(fā)現(xiàn)的病毒、支原體和其他細(xì)胞的污染。

細(xì)菌、霉菌和酵母到處存在，它們能在合適的環(huán)境中非常快速的生長。這些污染比較容易觀察到，它們往往會使其污染的培養(yǎng)液產(chǎn)生可見的變化，或者通過顯微鏡觀察就可以看見。

· 由于病毒有種屬特異性，所以病毒污染的概率比較小。但是病毒污染難于發(fā)現(xiàn)，因為病毒顆粒特別微小，一般的實驗室都沒能力檢查細(xì)胞培養(yǎng)中污染的病毒。由于病毒一般潛伏在細(xì)胞內(nèi)，對整個細(xì)胞培養(yǎng)不是致死的，所以它可能會使研究人員長期得到受病毒影響的細(xì)胞的實驗結(jié)果。

　　1956 年 Robinson 及其同事發(fā)現(xiàn)細(xì)胞培養(yǎng)中的支原體污染。90年代初美國的一個調(diào)查發(fā)現(xiàn)，在該國的細(xì)胞培養(yǎng)中，至少有15%被支原體污染。由于支原體沒有細(xì)胞壁，在細(xì)胞培養(yǎng)液中幾乎是透明的，同時對常用于細(xì)胞培養(yǎng)中的抗生素不敏感，不引起 pH 變化，不使培養(yǎng)液渾濁，所以支原體污染不容易被發(fā)現(xiàn)，但是其存在會影響實驗的結(jié)果。

　　細(xì)胞的交叉污染在細(xì)胞培養(yǎng)中發(fā)生的嚴(yán)重程度大大超過人們的想象：1981 年對ATCC細(xì)胞株的調(diào)查顯示：超過 60 標(biāo)記為其他細(xì)胞株的細(xì)胞居然是 HeLa 細(xì)胞。