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兩棲類DNA條形碼通用引物研究獲進展

閱讀:424發布時間:2016-1-21

DNA條形碼技術(DNA Barcoding)近年來已成為上生物多樣性研究的熱點,即利用標準基因片段對物種進行快速、準確的鑒定和識別。該技術正廣泛應用于生物多樣性調查、分子進化、生態、環境、食品安全等諸多領域。

在脊椎動物中,目前魚類,鳥類,以及極地動物在DNA條形碼研究中進展較快,已有大量相關數據庫在線。作為重要類群之一的兩棲爬行動物,進展一直較為緩慢。在對兩棲類的研究中,歐洲學者探討了DNA條形碼的鑒別能力,結果表明COI基因在該類群中鑒別物種方面是適合的,但是由于COI基因進化速率較快,序列保守性相對低,引物通用性差,極大阻礙了在兩棲類群中開展相關工作。

中科院昆明動物所車靜副研究員以及學生陳宏滿和楊軍校等人在張亞平院士的指導下,重新設計和優化了兩對COI通用兼并引物,在中國兩棲類的11個科、36個屬、82個種111個個體中進行了驗證,證實新設計的兩對引物能夠較廣泛的用于兩棲類DNA條形碼研究。該結果目前已在線發表Molecular Ecology Resources。該引物目前在爬行類群測試中也得到很好的驗證。

兩棲爬行類是動物界中*的一支,尤其兩棲類代表由水到陸的轉型過渡物種,對環境變化極為敏感,一直是研究環境和氣候變化的指示物種。針對兩棲爬行類DNA條形碼工作不足的現狀,昆明動物所于第四屆生命條形碼大會上提出兩棲爬行動物DNA條形碼“Cold Code”計劃,致力于在范圍內領導兩棲爬行類標準標記基因篩選、技術體系構建、標準文庫建設等方面發揮重要作用


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