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上海酶聯生物研究所
閱讀:1551發布時間:2011-4-11
宏基因組學
基因組學(genomics)
隨著人類基因組計劃的實施而誕生,現已成為后基因組時代一門重要的生命科學學科.研究者已經逐漸習慣于在對生物體的個別基因或蛋白質研究之前,先測定或分析該物種的基因組序列.目前已經知道全基因組序列的真核生物有40多種,而原核生物則多達200多種.這些工作表明,研究人員在基因組序列分析方面已經取得了巨大的進展.但是,對于自然界現存的物種而言,人類所測定的物種依然是少之又少.在原核生物世界中,僅僅是被命名的就達到5700種,而那些未知微生物的種類則可能多達上百萬種。
宏基因組 (也稱元基因組學, Metagenome)
是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名詞, 其定義為“the genomes of the total microbiota found in nature” , 即生境中全部微小生物遺傳物質的總和。它包含了可培養的和未可培養的微生物的基因, 目前主要指環境樣品中的細菌和真菌的基因組總和。
宏基因組學 (元基因組學, metagenomics)
就是一種以環境樣品中的微生物群體基因組為研究對象, 以功能基因篩選和/或測序分析為研究手段, 元基因組學( Metagenomics)通過非培養方法進行微生物群落組成的鑒定,主要技術包括DNA的提取、文庫的構建和目標基因克隆的篩選和元基因組直接進行高通量測序分析,可用于發現新基因、開發新的生物活性物質、研究群落中微生物多樣性和基因組成與功能預測等方面。 以微生物多樣性、種群結構、 進化關系、 功能活性、 相互協作關系及與環境之間的關系為研究目的的新的微生物研究方法。
特定生物種基因組研究使人們的認識單元實現了從單一基因到基因集合的轉變,宏基因組研究將使人們擺脫物種界限,揭示更高更復雜層次上的生命運動規律。在目前的基因結構功能認識和基因操作技術背景下,細菌宏基因組成為研究和開發的主要對象。細菌宏基因組細菌人工染色體文庫篩選和基因系統學分析使研究者能更有效地開發細菌基因資源,更深入地洞察細菌多樣性。如宏基因組成為生物催化劑的新來源。
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