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上海酶聯生物研究所
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閱讀：662發布時間：2011-1-13
通過基因分型方法，我們具有了分辨出結核分支桿菌隔離群分子“ 指紋”（基因型）的能力，這在很大程度上革新了我們對結核傳播的理解。
多方面的應用
在臨床上，基因分型可以幫助我們進行一些的鑒別。①排除實驗室交叉感染。據調查，由于交叉感染，大約3％的在實驗室診斷患者其實并沒有結核。此時實驗室結果和臨床癥狀并不一致，通過對隔離群和其他結核分支桿菌進行基因分型處理，可以讓真相大白，繼而終止交叉感染引起的錯誤的抗癆治療。②區分復發和再感染。確定再發結核是復發還是再感染很重要，因為只有前者代表治療失敗。如為復發，原隔離群的敏感性可以指導治療，并找到治療失敗的原因。如果證明為再感染，那么應該尋找來源。③檢測暴發。如果流行病學資料提示發生一次結核暴發，對分離物進行基因分型，結合流行病學調查，可以幫助確定是否真的發生了暴發，或者還是巧合出現了大量病例。
在流行病研究方面，流行病學不相關的結核基因型有很大變異性，反之，普通來源感染的患者其分離物基因型是相同的。因此，那些有相同或相近基因型的分離物被定義為群發的結核病例，zui近通常傳播。這個概念有兩點要注意。*，基因分型數據同流行病學資料一起解釋。例如，在很多城市，那些相同基因型的患者均為zui近感染，然而，在農村地區，共同的基因型并不反映均為zui近感染。第二，確定群發病例需要長期檢測人群中很大比例的病例，否則會影響結論的準確性。
分子流行病學研究已經幫助我們確定了很多容易暴發結核的地區，從而把公共衛生干涉的注意力集中于此。例如，在洛杉磯，無家可歸的避難所被確定為結核傳播的主要地點。
有益的提示
傳統的觀點認為結核分支桿菌菌株具有同等的毒力。然而，基于人群的基因分型已經表明一小部分菌株引起了與之不相稱的大量的病例，揭示有些菌株傳播力高于其他。如CDC1551菌株曾引起一次大暴發，從這個菌株提取的類脂可以激活單核細胞產生非常高濃度的炎性因子，這可能導致這類患者有異常大尺寸的結核菌素皮膚試驗反應。另一個研究中，感染了一種結核桿菌的小鼠不能參與一些特定的免疫反應，并且比感染另一種菌株的小鼠更快死亡。這些研究揭示各種各樣的結核桿菌對宿主有不同的作用，具有不同的傳播潛力。
傳播力zui強的結核分支桿菌菌株是北京家族，它曾導致世界范圍的暴發，組成這個菌株優勢家族分布于亞洲和北美洲的多數地區。北京家族包括在美國東北部大量暴發的W家族菌株，和在美國*南部流行的210菌株。
北京菌株可能廣泛分布，與其他菌株比較，北京菌株更易被霧化，可以更有效地建立傳染，或者更迅速地從感染發展為疾病。這個假設有三個發現支持。*，在越南，北京隔離群在年輕患者比老年患者更常見，提示這些菌株近期流行。第二，一個北京隔離群被引入一個島嶼后，它迅速流行，在三年內引起27％的結核病例。第三，北京家族的成員之一，210菌株，在巨噬細胞內比其他菌株生長更快，提示它能更有效地逃避宿主的抵御。
將來的前景
迄今為止，基因分型僅被有限數量的結核控制計劃應用。阻礙其廣泛應用的是基于IS6110的基因分型的復雜性，獲得數據所需的長期性和高額的費用。如果這些障礙能得到解決，前瞻性的基因分型研究可以與例行的結核控制活動結合起來，從而確定、防范可疑的暴發。
監督基因分型需要來源的保證；實驗室和公共衛生工作人員的密切交流；宜操作可重復的，快速的基因分型方法；能夠使用簡單的方法來比較大量分離物的基因型。較新的MIRU分析是監督基因分型zui有希望的候選方法，可以在數日內確定群發病。
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