一般水體和廢水以及污水處理中常見的微生物有：細菌Bacteria，真菌 Fungi，藻類 Aglae，原生動物 Protozoa，輪蟲 Rotifers, 甲殼綱動物Crustaceans，蟲類 Worms （線蟲Nematodes與扁蟲Flatworms）。
主要的檢測項目有細菌總數、酵母菌總數、霉菌總數、大腸桿菌總數等。
1. 細菌總數測定
1.1生化池水樣稀釋103倍、104倍、105倍、106倍和107倍后，分別取各稀釋液1mL接種于培養皿中，倒平板，于37℃生化培養箱中培養24h后，選取菌落數在30～300個之間的培養物進行計數，每個稀釋倍數做5個平行樣。
1.2取100mL水樣水浴至殘留少量水后，于105℃烘箱中烘至恒重，稱量水樣中活性污泥的干重，計算生化池水樣中每克干污泥的細菌總數。
2. 酵母菌總數測定
2.1生化池水樣稀釋102倍、103倍、104倍和105倍后，分別取各稀釋液1mL接種于培養皿中，倒平板，于30℃生化培養箱中培養48h后，選取菌落數在30～300個之間的培養物進行計數，每個稀釋倍數做5個平行樣。
2.2取100mL水樣水浴至殘留少量水后，于105℃烘箱中烘至恒重，稱量水樣中活性污泥的干重，計算生化池水樣中每克干污泥的酵母菌總數。
3. 霉菌總數測定
3.1生化池水樣稀釋102倍、103倍、104倍和105倍后，分別取各稀釋液1mL接種于培養皿中，倒平板，于30℃生化培養箱中培養72h后，選取菌落數在30～300個之間的培養物進行計數，每個稀釋倍數做5個平行樣。
3.2取100mL水樣水浴至殘留少量水后，于105℃烘箱中烘至恒重，稱量水樣中活性污泥的干重，計算生化池水樣中每克干污泥的霉菌總數。
4. 大腸菌群總數測定
4.1初發酵試驗：以無菌操作將各盛有3倍濃縮乳糖蛋白胨培養液5毫升的5支發酵管內，各接種污水樣10毫升，將各盛有單料乳糖蛋白胨培養液約10毫升5支的發酵管內，各接種污水樣1毫升，再將各盛有單料乳糖蛋白臟培養液約10毫升的5支發酵管內，各接種1∶10稀釋的污水樣1毫升（相當于原污水樣0.1毫升）。將此15支管已接種的發酵管置于37℃恒溫箱內，培養24小時。
4.2平板分離：經培養24小時后，將產酸產氣及只產酸不產氣的發酵管，分別接種于伊紅美蘭培養基或品紅亞硫酸鈉培養基上，置37℃恒溫箱培養18～24小時，挑選符合下列特征的菌落，取菌落的一小部分，進行涂片、革蘭氏染色、鏡檢。
菌落總數檢驗工作中會遇到各種實驗平板的菌落計數工作，如傾注法平板，螺旋接種平板，3M菌落總數測試紙片，濾膜法平板等。而且人工計數既消耗時間又耗人力，統計隨著人的疲勞度而加大，有的工作人員甚至為了減輕工作量草草了事。
迅數全自動菌落計數儀具有著不同類型平皿的統計功能，能夠保存平皿圖像和數據庫，方面查看驗證，迅數菌落分析儀器采用了菌落放大圖象拍攝，高分辨率的1000萬像素CCD數字成像技術和Colonfast菌落智能識別技術。
1. 針對細菌總數測定
在菌落自動計數方面，儀器可以快速完成包含細菌、霉菌、酵母菌等樣品的各類傾注法平板、涂布法平板、濾膜法平板、空氣沉降法平板、螺旋接種平板、3M紙片的菌落自動計數和濃度計算。自動計數菌落的速度高于500個菌落/秒，zui小可以分辨的菌落直徑可達 0.01mm；可構建計數模板以適應復雜實驗室環境，計數誤差控制在10%以內。
2. 針對酵母菌和霉菌
迅數菌落分析儀器內置特殊算法，支持對包含霉菌和酵母菌樣品的各類傾注法平板、涂布法平板、濾膜法平板、螺旋接種平板的菌落自動計數和濃度計算。
3. 針對大腸桿菌
迅數儀器的自動菌落計數能力可幫助實驗人員快速準確選取“菌落數在30到150的VRBA平板”；利用彩色高像素CCD成像及Colonfast圖象智能識別軟件，迅數菌落儀能迅速識別“紫紅色，有沉淀環，且直徑不小于0.5毫米”的大腸菌群菌落，只需1秒就計算出大腸菌群典型菌落的菌落數。
4. 一些特殊的污水中還存在著高致病性病原微生物，比如枯草芽胞桿菌黑色變種芽孢。
檢測方法：
1）取適量枯草芽孢桿菌黑色變種芽孢懸液，混入收集罐，使污水中菌液終濃度達到（2～8）×104/mL
2）按照污水處理程序依次進行化學消毒和物理消毒。
3）將濾膜在蒸餾水中煮沸消毒3次，每次15min；濾器用壓力蒸汽滅菌（121℃，20min）。
4）檢測采樣：消毒處理完畢后，用分度吸量管從污水收集罐的采樣口吸取100mL待排放的污水,在無菌的條件下用微孔濾膜過濾。
5）濾膜用50mL PB緩沖液洗滌，除去殘留消毒劑。
6）收集洗滌液，在無菌的條件下用微孔濾膜過濾。
7）將微孔濾膜在無菌條件下移放置胰大豆瓊脂平皿上進行細菌培養。濾膜應與培養基*緊貼，當中不得留有氣泡。
8）采樣平皿倒置于溫箱中35±0.5℃培養24±2 h后，進行枯草桿菌菌落計數。
對于濾膜、3M紙片等菌落計數，迅數的Colonfast菌落智能識別技術能夠識別菌落特征，實現快速自動計數。
杭州迅數科技有限公司是專業從事微生物分析測試技術研究與儀器裝備生產的高科技公司。目前主要生產自動菌落計數儀、螺旋接種微生物菌落分析儀、抑菌圈測量儀、β_內酰胺測定儀、抗生素效價分析儀、藻類計數儀、藻類輔助鑒定系統、浮游動物計數儀、生物顯微分析系統等產品。產品廣泛應用于科學研究、檢驗檢疫、質量監督、環境監測、疾控中心、藥品與生物制品檢定、食品藥品日化生產、以及鋼鐵石化化工電力等領域。
目前公司產品已成為中國科學院、中國農業科學院、中國檢驗檢疫科學院、中國藥品生物制品檢定所、中國動物衛生與流行病學中心、國家水產品質量監督檢驗中心、國家海洋局、以及上海寶鋼、蘭州石化等國內數千家企事業單位的產品。并成功服務于澳大利亞AMS實驗室的耐藥監測、法國威立雅水務集團的水質檢測、荷蘭*帝斯曼集團的菌種耐藥分析、美國藥明康德的毒理中心試驗、美國輝瑞藥業的抑菌圈（抗生素效價）自動檢測等場合。公司產品及優良的售后服務，受到國內外廣泛好評和歡迎。（迅數科技：）
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