電磁流量計的安裝與調試比其它流量計復雜，且要求更嚴格。傳感器和轉換器必須配套使用，兩者之間不能用兩種不同型號的儀表配用。在安裝傳感器時，從安裝地點的選擇到具體的安裝調試，必須嚴格按照產品說明書要求進行。安裝地點不能有振動，不能有強磁場。在安裝時必須使傳感器和管道有良好的接觸及良好的接地。傳感器的電位與被測流體等電位。在使用時，必須排盡測量管中存留的氣體，否則會造成較大的測量誤差。
電磁流量計信號不穩定三大主要原因之一：環境原因：在選型時我們就要先了解儀表現場環境，主要是空間電磁干擾，管道雜散電流，大電機磁場干擾等。空間電磁波干擾一般經信號電纜引入，通常采用單層屏蔽予以保護，但也曾遇到屏蔽保護還不能克服。管道雜散電流干擾通常采用取良好單獨接地保護可獲得滿意測量，但如遇管道有強雜散電流(如電解車間管道)亦不一定能克服，須采取流量傳感器與管道絕緣的措施。作為生產廠家要明白干擾所造成測量不準確的后果。
電磁流量計信號不穩定三大主要原因之二：管道系統和安裝導致：通常是電磁流量計傳感器安裝位置不正確引起的故障，常見的有將流量傳感器安裝在易積聚氣體的管網高點;流量傳感器后背壓，液體徑直排入大氣，形成其測量管內非滿管;裝在自上向下的垂直管道上，可能出現排空等原因。作為生產廠家要明白安裝不好所造成測量不準確的后果。
電磁流量計信號不穩定三大主要原因之三：流體的原因：兩種或兩種以上液體作管道混合工藝時，若兩種液體電導率(或各自與電極章電位)有差異，在混合未均勻前即進入流量傳感器進行流量測量，輸出信號亦會產生波動。低頻(50/16～50/6Hz)矩形勵磁電磁流量計測量液體中含有固體超過一定含量時將產生漿液噪聲，輸出信號亦會有一定程度波動。液體含有均勻分布細小氣泡通常不影響正常測量，惟所測得體積流量是液體和氣體兩者之和時，由于氣泡增大會使輸出信號波動，若氣泡大到流過電極遮蓋整個電極表面，使電極信號回路瞬時斷開，輸出信號將產生更大波動。電極材質與被測介質選配不善，產生鈍化或氧化等化學作用，電極表面形成絕緣膜，以及電化學和極化現象等，均會妨礙正常測量。作為生產廠家要明白介質中其它成分所造成測量不準確的后果。
電磁流量計的應用有一定局限性，它只能測量導電介質的液體流量，不能測量非導電介質的流量，例如氣體和水處理較好的供熱用水。另外在高溫條件下其襯里需考慮。電磁流量計是通過測量導電液體的速度確定工作狀態下的體積流量。按照計量要求，對于液態介質，應測量質量流量，測量介質流量應涉及到流體的密度，不同流體介質具有不同的密度，而且隨溫度變化。如果電磁流量計轉換器不考慮流體密度，僅給出常溫狀態下的體積流量是不合適的。電磁流量計用來測量帶有污垢的粘性液體時，粘性物或沉淀物附著在測量管內壁或電極上，使傳感器輸出電勢變化，帶來測量誤差，電極上污垢物達到一定厚度，可能導致儀表無法測量。
