當前位置:上海紀寧實業有限公司>>技術文章>>紀寧實業帶您了解血液RNA提取試劑盒的應用
RNA產品特點:
1.針對血液樣本*配置,操作更簡單、流程更優化。
2.配有高效的DNaseⅠ,可有效去除DNA污染。
3.配有CS過濾柱,可有效去除其它雜質。
4.RNA純度更高,無雜質殘留,特別適合于對純度要求很高的下游實驗。
5.操作安全可靠,無需酚/氯仿抽提,無需氯化銫梯度離心,無需氯化鋰或乙醇沉淀
用于血液樣本處理對RNA測序數據影響的研究
以血液這一為常用的臨床樣本為研究對象,重點研究了血液儲存時間以及外周血單核細胞(PBMC)樣本分離方法對其RNA測序數據質量的研究,對測序數據質量及準確度進行了探索分析,在差異表達基因分析的基礎上找到了一些規律性變化且與儲存時間相關的基因。
該研究能夠拓展高通量測序在臨床相關研究中的應用,促進其進一步發展。論文的主要研究內容如下:
1. 在PBMC樣本研究中,通過比較不同樣品處理間的基因表達差異,發現隨著貯藏時間的延長,差異逐漸擴大,而對總基因的影響不顯著。在PBMC測序數據中發現了5個隨時間呈梯度差異的基因,它們都是免疫相關基因,這些基因在以前的研究中沒有提及,這提示我們按照常規的生物標記分子篩選方法而不注重樣本處理無疑會產生偏差。此外,離心速度的影響大于保存時間,不同的離心速度可誘導差異表達。本文還分析了不同的貯存時間和離心速度對相同樣品的影響,為血液保存時期如何操作和處理樣本提供了理論依據。
2.在全血樣本研究中,通過比較相同樣品不同儲存時間的基因表達差異,發現24小時之內的基因表達差異不明顯。甚至于,人群差異大于儲存時間影響。然而,全血與PBMC的測序結果表明,大部分差異基因與紅細胞功能相關,這很有可能是血紅蛋白的權重太大造成的背景干擾。
因此,全血試劑盒提取RNA替代傳統PBMC提取雖然操作簡便,但血紅蛋白基因相關的背景干擾影響了結果。
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