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研究人員確定單細胞基因組學重要進展

時間:2015-3-17閱讀:167
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zui近,一種用于RNA序列分析的新方法,可讓研究人員確定新的細胞亞型,從看似全然混亂的狀態創造出秩序。這標志著我們向單細胞基因組邁進了重要的一步。

單細胞RNA測序是一種相對較新的技術,可以幫助人們了解基因在不同類型健康組織和癌癥中是如何表達的。它能夠在一次實驗中提供數百個單細胞的基因表達譜數據,從而產生單個細胞類型的準確信息。然而,單細胞轉錄組結構的根本復雜性,對于弄懂這些數據提出了一個重大挑戰。研究人員解釋說:“利用單細胞基因組學,我們能夠選取一個組織的細胞,根據它們的表達譜,把它們分成不同的類型,從而確定可能有一系列功能作用的細胞亞型。但是,為了正確地做到這一點,我們需要處理一些混雜因素,直到現在,我們還沒有可靠的方法解決這些混雜因素。"來自一種組織類型的樣本具有固有的復雜性:一些細胞將會是新的,一些則是舊的,在任何給定的時間點上它們將處于細胞周期的不同階段。大多數細胞類型也有隱藏的亞型,每一種可能具有不同的功能。

研究人員解釋說:“如果你所有的數據都來自于單細胞的基因表達,你就需要一種方法來識別和糾正可區分單個細胞的潛在因素,所以你可以了解其深層的生物學因素。我們的模型解釋了單細胞之間的關聯性,例如它們是否處于細胞周期的相同階段,識別可能混雜的變量,并去除它們。這也使我們更容易發現新的細胞亞型——你可能不知道已存在的變量,然后一并糾正它們。"

研究人員表示:“單細胞類型分析,對于生物醫學研究是至關重要的。我們可以根據已知的、詳細的細胞構成,更好地研究和了解癌細胞、分化過程以及各種疾病的發病機制。現在我們的模型可利用單細胞基因組學進行這種分析。"

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