一、KO小鼠模型構建技術路線選擇
方法 | 周期 | 成本 | 適用場景 | 優(yōu)勢/劣勢 |
---|---|---|---|---|
CRISPR-Cas9 | 2-4個月 | 低至中 | 簡單敲除、短片段插入 | 快、成本低,但可能脫靶 |
ES細胞同源重組 | 6-12個月 | 高 | 復雜修飾(如條件性KO、大片段替換) | 精準,但周期長、需顯微操作 |
Base Editing | 3-5個月 | 中至高 | 單堿基敲除(無DSB) | 避免雙鏈斷裂,但效率較低 |
二、KO小鼠模型構建CRISPR-Cas9 方案(當前常用)
1. 設計gRNA
靶點選擇:
針對目標基因的外顯子(優(yōu)先選擇首ge編碼外顯子)。
使用在線工具(如Benchling或CRISPR Design)避免脫靶。
合成gRNA:化學合成或體外轉(zhuǎn)錄(需加5'端G增強轉(zhuǎn)錄效率)。
2. 構建打靶載體(可選)
供體DNA:若需同時插入報告基因(如GFP),需設計同源臂(~800 bp)。
3. 受精卵注射
注射混合物:
Cas9 mRNA(50 ng/μL) + gRNA(25 ng/μL) ± 供體DNA(100 ng/μL)。
胚胎操作:
注射C57BL/6或BALB/c品系受精卵(原核期)。
移植至假孕母鼠子宮(約30個胚胎/母鼠)。
4. 基因型鑒定
F0代篩查:
PCR + 測序:檢測Indel突變(引物設計在gRNA靶點外)。
T7E1或Surveyor assay:快速檢測切割效率。
傳代驗證:F0可能為嵌合體,需與野生型交配獲得F1雜合子。
5. 表型分析
完quanKO驗證:qPCR/Western blot確認基因表達缺失。
表型檢測:根據(jù)基因功能設計(如代謝、行為學、病理分析)。
三、ES細胞打靶方案(傳統(tǒng)方法)
1. 靶向載體構建
同源臂:5'和3'臂各1.5-3 kb, flanking 目標外顯子。
篩選標記:NeoR(正選擇)和TK(負選擇,如HSV-TK)。
2. ES細胞轉(zhuǎn)染與篩選
電轉(zhuǎn)遞送:將線性化載體轉(zhuǎn)入JM8或E14 ES細胞。
藥物篩選:G418(NeoR) + 更xi洛韋(TK陰性篩選)。
3. 囊胚注射與嵌合體獲得
顯微注射:將陽性ES細胞注入C57BL/6囊胚。
嵌合體鑒定:毛色嵌合(如129 ES細胞→B6母鼠)。
4. 生殖系傳遞
嵌合體(公鼠)與野生型交配,篩選后代基因型。
四、條件性KO(cKO)附加步驟
設計floxed小鼠:
在目標外顯子兩側(cè)插入loxP位點(需同源重組或CRISPR-HDR)。
與Cre小鼠交配:
選擇組織特異性Cre品系(如Alb-Cre用于肝臟敲除)。
驗證敲除效率:
在目標組織中檢測基因缺失(避免全身性表型干擾)。
五、常見問題與解決方案
問題 | 原因 | 解決方案 |
---|---|---|
F0無突變 | gRNA效率低或Cas9活性不足 | 優(yōu)化gRNA設計,提高注射濃度 |
嵌合體不傳代 | ES細胞貢獻不足 | 改用高貢獻率ES細胞系(如JM8A3.N1) |
非預期表型 | 脫靶效應或相鄰基因影響 | 多獨立品系驗證,全基因組測序排查 |
條件性KO不完quan | Cre表達效率低 | 換用強效Cre品系(如UBC-CreERT2) |