DGiNaSPTM系統(tǒng)工作流程：單細胞分離到NGS分析
流程特點：
· 更低成本：靶向基因檢測，避免看家基因占用的大量測序數(shù)據(jù)，大大節(jié)省了測序和分析成本；
· 罕見轉(zhuǎn)錄本更高檢出率：靶向定制panel，選定特定基因組合，提高UMI計數(shù)效率，罕見轉(zhuǎn)錄本檢測閾值更低；
· 超高細胞捕獲效率：大于60%，遠高于市場上目前所有大通量單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術；
· 克服PCR擴增偏差：引入單細胞測序金標準，分子標簽，降低非特異性表達；
· 實現(xiàn)更高的分辨率：可以分辨更精細、微觀的細胞群和細胞亞種群；
· 反轉(zhuǎn)錄的磁珠超長穩(wěn)定存儲：完整cDNA可在磁珠微球結(jié)構保存長達16周，隨用隨取；
· 靈活分樣組合：單次實驗，通過的抗體標記的方法，既可以提高樣品通量（*多可8個樣本同時建庫，可等分，可隨機組合）；又可以同時進行單細胞蛋白和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合檢測，大大降低成本的同時，也為單細胞多組學研究提供了更高效的平臺
靶向設計
近年來高通量測序平臺的快速發(fā)展引發(fā)了測序成本迅速激進的成本降低，但相對于大量的單細胞轉(zhuǎn)錄組分析需求來說仍是十分昂貴的。我們通過特殊序列設計的方法，開發(fā)出了多款適用于不同客戶需求的靶向基因檢測試劑盒。具有以下優(yōu)點。
l 更低成本--提高單細胞測序效率，避免看家基因占用的大量測序數(shù)據(jù)，大大節(jié)省了測序和分析成本；
l 罕見轉(zhuǎn)錄本更高檢出率--選定特定基因組合，提高UMI計數(shù)效率，罕見轉(zhuǎn)錄本檢測閾值更低；
l 定制化—提供客戶定制化服務，專門的設計軟件和應用專家提供專業(yè)的設計指導和服務
l 儲存--從樣本中得到的完整 cDNA 可在磁珠上穩(wěn)定存儲，允許將珍貴樣本保存長達 16 周。這可使用戶在時間允許的情況下靈活地對樣本進行測序，并通過對儲存的磁珠池進行等分或分樣來實現(xiàn)同一樣本的多個測定。
l 分樣--在磁珠上儲存的 cDNA可以分成一個或多個等分試樣，并使用定制或預先設計的組合（panel）進行擴增。通過提供對部分樣本進行測序的選項和對樣本不同組合（panel）進行測試的靈活性，進一步降低成本。
分子標記索引
當對序列讀取進行計數(shù)時，PCR 擴增偏差可導致基因定量不準確。DGiNaSPTM分子標簽（UMI）技術為單個細胞的單個基因分配了的分子索引，也稱為“分子條形碼”。實驗者可借此克服擴增偏差，更準確地計算轉(zhuǎn)錄水平。
磁珠上分子標簽結(jié)構。Univ：通用Illumina接頭序列。CL：Cell specific sequence細胞特異序列。大約有88.5萬種細胞標記。UMI：Unique molecular index。每個mRNA分子有相同標簽。UMIs種類：約6.6萬。Poly-dT：mRNA尾連接。
單分子標記流程示意圖
我們?yōu)榭蛻籼峁┒喾N數(shù)據(jù)分析安裝分析軟件和可視化工具，可構建自動化的數(shù)據(jù)分析通道。只需對簡單的生物信息學基本了解即可方便的進行初級分析和二級分析以及數(shù)據(jù)可視化等各種數(shù)據(jù)分析和挖掘，直接生成可用于發(fā)表的結(jié)果和圖片
工作條件：
電壓要求：100-240 Vac, 50-60 Hz, 25 W；
溫度要求：16-28°C；
濕度要求：室溫，不高于85%；
具體參數(shù)
芯片適用樣品類型:一種微流體芯片兼容不同大小及不同類型的真核細胞（貼壁細胞、懸浮細胞、組織、血液等）；
樣本處理通量：反應孔數(shù)量達到了22萬個，1-8個通道，單個通道每次可捕獲100-10000單細胞；
自動化：一體化主機設置，可從細胞分離到建庫完成需要12.5小時，所有步驟均在一個單元完成實現(xiàn)全自動分離建庫，實現(xiàn)快速裂解細胞對基因表達影響*小，**地獲得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)；
分區(qū)與標簽數(shù)：每次運行產(chǎn)生≥9萬個納升級分區(qū)，含有不少于270 萬個的序列標簽、**標簽或ATAC標簽（每個標簽由16個堿基構成）；
細胞捕獲效率：在樣本細胞群體中捕獲≥60%的單細胞，每 1000 個細胞中含有 雙細胞的比例低于0.9%；
文庫測序儀兼容性：系統(tǒng)提供 Illumina和華大基因兼容測序文庫，建庫樣本滿足 Illumina 和華大基因測序儀要求；
細胞直徑大小：≤40um；大于40um抽提細胞核檢測試劑盒；
多樣本標記: 配套原廠試劑，可以完成細胞樣本及細胞核樣本混樣建庫，細胞樣本混樣單個通道達到10種樣本標簽，細胞樣本或細胞核樣本混樣單次實驗可達到80個樣本建庫實驗；
條碼掃描器: 配備2D 條形碼掃描器，掃描試劑信息并跟蹤試劑使用情況；
軟件包括：分析軟件和可視化軟件，免費安裝，免費升級，自帶誤操作提示及更正功能，支持 Wifi，以太網(wǎng)，USB 接口輸出，兼容 LIMS 系統(tǒng)；
目前已有多款經(jīng)驗證的試劑盒可選：
□ 單細胞的基因 3’表達譜測序文庫試劑盒
□ 單細胞的基因5’表達譜測序文庫試劑盒
□Onco-BC 靶向檢測試劑盒（panel）--與乳腺癌和**細胞相關的 400 個基因檢測
□ **反應檢測試劑盒（panel）--**細胞類型譜分析
□ T-細胞靶向檢測試劑盒（panel）--T細胞類型譜分析
□ 單細胞核的ATAC-Seq測序文庫試劑盒
□ 多聚甲醛固定后單細胞轉(zhuǎn)錄組測序文庫試劑盒
□ 客戶自定義檢測試劑盒（panel）--用戶可選擇100-500個靶基因進行檢測，專業(yè)的應用工程師將為您的設計提供技術支持
