群落光合生態的研究是植物物質生產研究的基礎之一，群落凈光合速率是研究群落生產能力及其與外部環境因子間關系的更好尺度, 特別是區域乃至尺度碳循環的研究。
在不考慮人為因素與動物活動影響的情況下，陸地與大氣之間的凈生態系統交換量NEE相當于植物光合作用固定的碳通量PG與生態系統呼吸釋放的碳通量Reco的差值（-NEE=PG-Reco=PG-（Rl+Rt）-Rs）。Rl是植物葉片呼吸速率，Rt是植物莖稈的呼吸速率，Rs是土壤呼吸速率。NEE為正值表明是碳釋放（碳源），為負值表示碳吸收（碳匯）。
所以群落的凈光合速率就是Pn=PG-（Rl+Rt）=-NEE+Rs
測量群落凈光合速率一種常見的方法是使用CO2分析儀結合大型開路式自動箱測量，自動箱大多以國外廠家的產品為，但大尺寸的自動箱邊框、支架對測點的降雨、風速等小氣候有影響。小尺寸的自動箱測量面積小，高度低，只能用于裸地、草地。
本試驗采用了澳作自主研發的iChamber S62型群落自動箱，的無框架、無立柱設計，高度隨植物生長可調。對測量點降雨、風速等小氣候無影響，抗風12級。
測定時將一個直徑62cm，高度80cm的iChamber自動箱罩在待測植物上, 確保自動箱與地面接觸位置密封。自動箱的罩子是透明的，箱內有一個小風扇以混合均勻箱內的氣體，使其內的環境狀態限度地接近自然環境狀態。箱內還裝有一個測定箱內氣體溫度的溫度計。
測量時，透明罩子升起，上面蓋子蓋好形成密閉空間，用一個循環氣泵把箱內的氣體抽出然后再送回自動箱內，在循環氣路上利用分流閥把氣流通向EGA60紅外分析儀連續測量CO2和H2O濃度,然后從分析儀出氣口再把氣體通過另外一個分流閥送回自動箱的循環氣路。 為保證數據質量, 設置每2秒自動記錄一次CO2和H2O濃度值，記錄時間一般為120 s左右。根據自動箱內CO2的濃度值變化計算出NEE。完成NEE測定之后, 降下自動箱的
透明罩子，讓植物恢復到以前的自然環境。
然后再用一個裝有黑色罩子的iChamber S62自動箱，測量植物群落附近裸土的土壤呼吸速率Rs，氣路連接和上面測NEE的方式一樣，設置每2秒自動記錄一次CO2和H2O濃度值，記錄時間一般為120 s左右 ，此時測定土壤呼吸速率(Rs)。用NEE和Rs的差值計算群落的凈光合速率(Pn)。
