磁性分離器適用于水基冷卻劑和低粘度油，磁性分離器經常是作為一個有效的過濾器前期預處理設備，可以減緩過濾器的堵塞并節省過濾器的耗材消耗。
配套磨床水箱使用的磁性分離器常見的形式有膠輥式磁性分離器及梳齒式磁性分離器。
膠輥式磁性分離器磨屑與磁筒表面的不銹鋼管會不斷摩擦，同時刮屑板與不銹鋼管也會摩擦，經過長時間使用，磁筒不銹鋼管表面會慢慢磨損變薄，直至不銹鋼管磨透，磨削液會滲漏進磁筒內部。不銹鋼管表面會翹起與刮屑板干涉，需要維修或更換。這種形式分離器常規處理量為10-500升每分。
梳齒磁性分離器由于磁輥呈梳齒狀，因此成倍的增加了吸附面積。梳齒磁性分離器的磁筒長時間使用后也要考慮整體更換。
使用紙帶過濾機處理零件加工時切下的金屬顆粒和砂粒雜質，濾渣會與濾紙黏附在一起，使用后濾紙無法再使用，只能與濾渣一起拋棄處理，既增加濾紙的使用成本又會產生環保問題。采用磁性分離器與紙帶過濾機組合處理雜質，可以減緩濾紙的用量，但濾紙的拋棄處理問題沒有解決。
采用強磁性的磁性分離器，不采用過濾紙，是性價比較好的一種解決方案。這種方法既能以較小的成本達到較高的分離精度，又不會對環境造成影響。這種方式是采用磁性分離器，水箱及水泵組合。其中磁性分離器做改進設計，可采用釹鐵硼作為磁體，磁力強勁。磁體布置特殊設計，使吸附的雜質掉落容易。配套磨床水箱使用的磁性分離器按要求制作。
