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上海金穗生物科技有限公司

胞外轉(zhuǎn)錄反應(yīng) (in vitro transcription)

時間:2013-2-19閱讀:315
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由于RNA聚合酶一般由數(shù)個次單元組合而成,早先要在試管內(nèi)應(yīng)用RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄活性合成RNA并非易事,但這個問題在SP6, T3 及T7 等噬菌體的RNA聚合酶陸續(xù)被發(fā)現(xiàn)以后,情況已*改觀。這主要是因為這類RNA聚合酶由一條多勝肽 (polypeptides) 所構(gòu)成,其在進(jìn)行轉(zhuǎn)錄反應(yīng)時所須辨認(rèn)的啟動子長度僅20bp左右,而且轉(zhuǎn)錄起始位置非常明確,轉(zhuǎn)錄效能良好,成了目前進(jìn)行胞外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)時的*選擇。要進(jìn)行胞外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)時,僅需將目標(biāo)基因次選殖 (subclone)至帶有SP6, T3 或T7 啟動子的轉(zhuǎn)錄載體,或者運(yùn)用PCR技術(shù)在基因的一端加上SP6, T3 或T7 啟動子的序列,即可運(yùn)用對應(yīng)的RNA聚合酶活性在試管內(nèi)合成正意股或反意股RNA。 以質(zhì)體DNA為模版進(jìn)行胞外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)前,應(yīng)先用限制酶自目標(biāo)基因的一端切開,以免轉(zhuǎn)錄反應(yīng)持續(xù)進(jìn)行至載體的序列 (run-on),但在選擇限制酶切位時應(yīng)避免使用目標(biāo)基因也帶有的切位;限制酶內(nèi)切好的質(zhì)體DNA經(jīng)phenol/chloroform萃取的后,即可用來進(jìn)行胞外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。
儀器用具:微量離心機(jī)
藥品試劑: Plasmid DNA 酵解產(chǎn)物pBlueGus/HindIII 及pBlueGus/BamHI;5×Transcription buffer (200 mM Tris-Cl, pH 8.0; 40 mM MgCl2; 10 mM;spermidine-(HCl)3; 125 mM NaCl; Roche)NTPs (含ATP, CTP, GTP 及UTP 各2.5 mM);RNase 抑制劑RNasin (40 U/μL);T7 與T3 RNA polymerase (Roche) ;dH2O/DEPC;100 mM DTT (dithiothreitol);DNase (RNase-free)
Phenol/chloroform/isoamyl alcohol (25:24:1), 以下簡稱PCI;Chloroform/isoamyl alcohol (24:1), 以下簡稱CI

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